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Massenspektrometer für den Instrumentenpark Proteomics

Vienna BioCenter Core Facilities GmbH

Allgemeine Angaben

Kerndaten für die freiwillige Bekanntmachung eines Vergabeverfahrens ohne vorherige Bekanntmachung (Anhang VIII, 1. Abschnitt, Z 4 BVergG 2018)

a) Name des Auftraggebers

Vienna BioCenter Core Facilities GmbH

b) Stammzahl des Auftraggebers gemäß § 6 E GovG sowie eine eindeutige, vom Auftraggeber vergebene Geschäftszahl des Vergabeverfahrens (Stammzahl-Geschäftszahl)

9110017627747-1

c) Kontaktstelle des Auftraggebers

TERZAKI Unternehmensberatung, Mag. Alexandra Terzaki, 1190 Wien.

+43 13695978

office@terzaki.at

d) CPV-Code Hauptteil bzw. Hauptteile

38433100

e) CPV-Code Zusatzteil bzw. Zusatzteile (sofern vorhanden)

f) Art des Auftrages (Bau-, Liefer- oder Dienstleistungsauftrag)

Lieferauftrag

g) NUTS-Code des Erfüllungsortes bzw. des Hauptortes der Ausführung

AT

h) Bezeichnung des Auftrages

Massenspektrometer für den Instrumentenpark Proteomics

i) Kurze Beschreibung des Auftrages

Upgrade von 1 Stk. Massenspektrometers Orbitrap Eclipse Tribrid und 4 Stk. OrbiTrap Exploris 480

j) Bei Zielschuldverhältnissen: in Aussicht genommener Erfüllungszeitpunkt (TT/MM/JJJJ; Angabe nur, soweit bekannt)


k) Bei Dauerschuldverhältnissen: Laufzeit des Vertrages (in Monaten oder Tagen; Angabe nur, soweit bekannt)

l) Name des Bieters, welchem der Zuschlag erteilt werden soll

Thermo Fisher wissenschaftliche Geräte GmbH

m) Beschreibung der maßgeblichen Gründe für die Durchführung eines Vergabeverfahrens ohne vorherige Bekanntmachung oder URL auf eine solche Beschreibung

Die Entscheidung für ein Verhandlungsverfahren ohne vorherige Bekanntmachung wird mit der technischen Alleinstellung bzw. den spezifischen Anforderungen der existierenden Core-Facility begründet.Das Upgrade betrifft vier Q-Exactive HF-X Massenspektrometer und ein OrbiTrap Lumos Massenspektrometer. Die Geräte werden für die Anwendung und Weiterentwicklung der Methoden im Bereich quantitativer Proteomik verwendet und in einer Vielzahl von groß angelegten Proteomik Projekten eingesetzt, in denen sehr komplexe Peptidgemische mit Tandem Mass Tags (z.B. TMT16 plex) markiert und analysiert werden. Es muss sichergestellt werden, dass mit den neu anzuschaffenden Geräten, die laufenden Projekte weiter durchgeführt werden können. Eine existierende Softwareplattform (Proteome Discoverer) muss kontinuierlich weiterbetrieben werden und daher das Datenformat kompatibel sein. Wegen des Einsatzes in der Core Facility müssen Standardabläufe eingehalten werden. Daher müssen die Geräte mit den vorhandenen Arbeitsabläufen (Probenvorbereitung und Datenanalyse), sowie vorhanden HPLC Geräte (U-3000 von Thermo-Fisher) kompatibel sein. Wegen des begrenzten Laborplatzes im MS-Raum (VBC-6) muss es sich um Benchtop-Geräte handeln, dessen Außenabmessungen 800 mm x 1 300 mm x 1 000 mm (BxHxT) nicht überschreiten.Orbitrap Eclipse Tribrid - Technische Alleinstellung: • Extrem hohe Auflösung von 500.000 FWHM bei m/z 200 • Verschiedene, miteinander kombinierbare Fragmentierungstechniken: CID, ETD, HCD, die auch kombinierbar sind (EThcD) ; das ist besonders hilfreich bei Top Down und PTM Analysen, z.B. Glycopeptide-Identifikation • 3 mit einander kombinierbare Massenanalysatoren: segmentierter Quadrupol, Orbitrap, duale lineare IonTrap mit MSn-Möglichkeit • FAIMS PRO (High Field Asymmetric waveform Ion Mobility Spectrometry) zur Verbesserung von Protein und Peptid-Identifizierungen • Elektrosprayionisationsmassenspektrometer für Nanoliter-Flüsse • hochauflösender Massenanalysator für den Bereich m/z 50 – 6000 • Massengenauigkeit von kleiner 1 ppm (bei interner Echtzeitmassenkalibrierung • synchronen Vorläuferionenselektion mittels Multi-Notch-MS3 Funktionalität für die Proteinquantifizierung mittels TMT (z.B. 16-plex) • subfemtomolare Sensitivität, • Advanced Peak Detection Algorithmus (APD) für eine verbesserte Precursor-Zuordnung • ETD-HD • HCTT (High Capacity Transfer Tube zur Verbesserung der Sensitivität • Ion Funnel (keine S-lens) EP 1371081, EP 2442351 (Orbitrap ion injection) DE 112004003144 (B4) (Optimized Instrument utilization) EP 1900002 (B1) (Improved Orbitrap mass analyzer geometr) EP 1894226 (B1) (Ion Multiplexing Technology) EP 2372747 (B1) (eFT enhanced Resolution Features) • das Massenspektrometer darf keine externen Gase außer Stickstoff und keine Stickstoffkühlung benötigen.Orbitrap Exploris – Technische Alleinstellung: • Elektrosprayionisationsmassenspektrometer für Nanoliter-Flüsse • Extrem hohe Auflösung von 480.000 FWHM bei m/z 200 im positiven and negativen Modus (EP1900002, EP 2372747), • FAIMS PRO (US 6,504,149; US 8,664,593) zur Verbesserung von Protein und Peptid-Identifizierungen, • das Massenspektrometer darf keine externen Gase außer Stickstoff und keine Stickstoffkühlung benötigen • Paralleles Füllen und Detektion der Ionen um den Scangeschwindigkeit zu verbessern (DE 112004003144) • Segmentierter Massenfilter, der eine variable und stufenlose Auswahl der Breite der Vorläuferisolation ermöglicht von 0.4 Da bis zum vollen Massenbereich; Massengenauigkeit von 1 ppm RMS mit interner Kalibrierung • Advanced Peak Detection Algorithmus (APD) für eine verbesserte Precursor-Zuordnung.

n) Gegebenenfalls Tag der Absendung der Bekanntmachung an das Amt für Veröffentlichungen (TT/MM/JJJJ)

15/09/2020

o) Tag der erstmaligen Verfügbarkeit der Bekanntmachung (TT/MM/JJJJ)

17/09/2020

p) Angabe des Zeitpunktes der letzten Änderung der Ausschreibung (TT/MM/JJJJ, hh:mm)

17/09/2020, 14:00

  
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